Prakarsa Borneo bekerja pada isu-isu hukum yang berkaitan dengan sumber daya alam di Paser, Kalimantan Timur. Kerja Prakarsa Borneo dengan SETAPAK berada di bawah tema tata kelola hutan dan lahan sebagai berikut:
Meningkatkan kebijakan nasional dan lokal
Prakarsa Borneo berupaya untuk meningkatkan regulasi-regulasi propinsi untuk menegakkan reklamasi lahan pasca pembersihan penambangan. Reklamasi lahan dan penghijauan sangat penting untuk meningkatkan kesehatan hutan. Organisasi ini juga memperkuat unit pengelolaan hutan Telake di Paser yang memainkan peran integral dalam memastikan kesesuaian dan keberlanjutan hutan serta penggunaan lahan di Paser.
Media, pendidikan, dan penjangkauan (outreach)
Prakarsa Borneo mengembangkan serangkaian publikasi mengenai kerja mitra SETAPAK di Kalimantan Timur dan Kalimantan Utara yang merupakan sumber penting bagi advokasi. Mereka mengadvokasi perlindungan sistim tangkapan air Sungai Wain. Sebuah kebijakan singkat telah dikembangkan dengan penjelasan manfaat kawasan ekologi tangkapan air.